1、分布范围不同。文蛤是埋栖型贝类，多分布在较平坦的河口附近沿岸内湾的潮间带，以及浅海区域的细沙，泥沙滩中，靠斧足的钻掘作用有潜沙习性。而蛤蜊是青岛、大连、烟台、威海等沿海城市的独特海产品，在大连被称为蚬子蛤蜊在青岛被俗称gá la（此处为轻声）烟台称为蛤（gǎ）。蛤蜊的中文名叫杂色蛤仔，栖息在潮间带中、下区以下的泥沙滩海底，以干潮线以下产量最多。
2、营养价值不同。蛤蜊肉的营养价值丰富，在每100克蛤肉中含蛋白质10克、脂肪1.2克、碳水化合物2.5克，以及碘、钙、磷、铁等多种矿物质和维生素，而蛤壳中则含碳酸钙、磷酸钙、硅酸镁、碘、溴盐等。现代医学研究发现，在文蛤中有一种叫蛤素的物质，有抑制肿瘤生长的抗癌效应。